Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms