Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn6Q9Z262 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms