Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

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Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Nek3Q9R0A5 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Nek3Q9R0A5 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Nek3Q9R0A5 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms