Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms