Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
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Tlr5Q9JLF7 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Tlr5Q9JLF7 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Tlr5Q9JLF7 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Tlr5Q9JLF7 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms