Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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