Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms