Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms