Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6N1

Ca13, Carbonic anhydrase 13, mousemouse

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ca13Q9D6N1 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ca13Q9D6N1 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ca13Q9D6N1 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ca13Q9D6N1 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ca13Q9D6N1 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ca13Q9D6N1 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ca13Q9D6N1 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ca13Q9D6N1 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ca13Q9D6N1 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ca13Q9D6N1 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ca13Q9D6N1 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Ca13Q9D6N1 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ca13Q9D6N1 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ca13Q9D6N1 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ca13Q9D6N1 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ca13Q9D6N1 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ca13Q9D6N1 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ca13Q9D6N1 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ca13Q9D6N1 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ca13Q9D6N1 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ca13Q9D6N1 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ca13Q9D6N1 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ca13Q9D6N1 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ca13Q9D6N1 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Ca13Q9D6N1 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Ca13Q9D6N1 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Ca13Q9D6N1 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ca13Q9D6N1 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Ca13Q9D6N1 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ca13Q9D6N1 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ca13Q9D6N1 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ca13Q9D6N1 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ca13Q9D6N1 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ca13Q9D6N1 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ca13Q9D6N1 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ca13Q9D6N1 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ca13Q9D6N1 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Ca13Q9D6N1 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ca13Q9D6N1 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ca13Q9D6N1 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ca13Q9D6N1 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ca13Q9D6N1 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ca13Q9D6N1 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ca13Q9D6N1 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ca13Q9D6N1 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ca13Q9D6N1 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ca13Q9D6N1 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Ca13Q9D6N1 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Ca13Q9D6N1 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Ca13Q9D6N1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ca13Q9D6N1 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ca13Q9D6N1 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ca13Q9D6N1 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ca13Q9D6N1 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ca13Q9D6N1 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ca13Q9D6N1 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Ca13Q9D6N1 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ca13Q9D6N1 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ca13Q9D6N1 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ca13Q9D6N1 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ca13Q9D6N1 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ca13Q9D6N1 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ca13Q9D6N1 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ca13Q9D6N1 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ca13Q9D6N1 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ca13Q9D6N1 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ca13Q9D6N1 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ca13Q9D6N1 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ca13Q9D6N1 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
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Ca13Q9D6N1 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms