Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cmtm5Q9D6G9 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms