Protein–RNA interactions for Protein: Q9D552

Spata17, Spermatogenesis-associated protein 17, mousemouse

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata17Q9D552 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spata17Q9D552 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spata17Q9D552 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spata17Q9D552 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spata17Q9D552 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spata17Q9D552 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spata17Q9D552 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spata17Q9D552 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Spata17Q9D552 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spata17Q9D552 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spata17Q9D552 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spata17Q9D552 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spata17Q9D552 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spata17Q9D552 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spata17Q9D552 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spata17Q9D552 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spata17Q9D552 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spata17Q9D552 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spata17Q9D552 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spata17Q9D552 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spata17Q9D552 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Spata17Q9D552 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Spata17Q9D552 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spata17Q9D552 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spata17Q9D552 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spata17Q9D552 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spata17Q9D552 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spata17Q9D552 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spata17Q9D552 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spata17Q9D552 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spata17Q9D552 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spata17Q9D552 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spata17Q9D552 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spata17Q9D552 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spata17Q9D552 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spata17Q9D552 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spata17Q9D552 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spata17Q9D552 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spata17Q9D552 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spata17Q9D552 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spata17Q9D552 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Spata17Q9D552 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spata17Q9D552 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spata17Q9D552 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spata17Q9D552 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spata17Q9D552 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spata17Q9D552 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spata17Q9D552 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spata17Q9D552 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spata17Q9D552 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Spata17Q9D552 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Spata17Q9D552 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spata17Q9D552 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spata17Q9D552 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spata17Q9D552 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spata17Q9D552 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spata17Q9D552 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spata17Q9D552 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spata17Q9D552 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spata17Q9D552 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spata17Q9D552 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spata17Q9D552 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spata17Q9D552 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spata17Q9D552 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spata17Q9D552 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spata17Q9D552 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spata17Q9D552 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spata17Q9D552 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spata17Q9D552 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spata17Q9D552 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spata17Q9D552 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Spata17Q9D552 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spata17Q9D552 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spata17Q9D552 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spata17Q9D552 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spata17Q9D552 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spata17Q9D552 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spata17Q9D552 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spata17Q9D552 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms