Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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