Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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