Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms