Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Ifitm3Q9CQW9 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Ifitm3Q9CQW9 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Ifitm3Q9CQW9 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ifitm3Q9CQW9 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
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