Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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