Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
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Chmp3Q9CQ10 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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Chmp3Q9CQ10 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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Chmp3Q9CQ10 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Chmp3Q9CQ10 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Chmp3Q9CQ10 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Chmp3Q9CQ10 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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Chmp3Q9CQ10 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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Chmp3Q9CQ10 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
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Chmp3Q9CQ10 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms