Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Bhlhe41Q99PV5 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms