Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GpnmbQ99P91 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
GpnmbQ99P91 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GpnmbQ99P91 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GpnmbQ99P91 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GpnmbQ99P91 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
GpnmbQ99P91 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
GpnmbQ99P91 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GpnmbQ99P91 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GpnmbQ99P91 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GpnmbQ99P91 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GpnmbQ99P91 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GpnmbQ99P91 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GpnmbQ99P91 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GpnmbQ99P91 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GpnmbQ99P91 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GpnmbQ99P91 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GpnmbQ99P91 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GpnmbQ99P91 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GpnmbQ99P91 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GpnmbQ99P91 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GpnmbQ99P91 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GpnmbQ99P91 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GpnmbQ99P91 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GpnmbQ99P91 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GpnmbQ99P91 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GpnmbQ99P91 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GpnmbQ99P91 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GpnmbQ99P91 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GpnmbQ99P91 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GpnmbQ99P91 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GpnmbQ99P91 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GpnmbQ99P91 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GpnmbQ99P91 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GpnmbQ99P91 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GpnmbQ99P91 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GpnmbQ99P91 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GpnmbQ99P91 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GpnmbQ99P91 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GpnmbQ99P91 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GpnmbQ99P91 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GpnmbQ99P91 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GpnmbQ99P91 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GpnmbQ99P91 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GpnmbQ99P91 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GpnmbQ99P91 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GpnmbQ99P91 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
GpnmbQ99P91 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GpnmbQ99P91 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GpnmbQ99P91 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GpnmbQ99P91 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GpnmbQ99P91 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GpnmbQ99P91 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GpnmbQ99P91 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GpnmbQ99P91 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
GpnmbQ99P91 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
GpnmbQ99P91 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GpnmbQ99P91 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GpnmbQ99P91 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GpnmbQ99P91 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GpnmbQ99P91 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GpnmbQ99P91 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GpnmbQ99P91 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GpnmbQ99P91 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GpnmbQ99P91 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GpnmbQ99P91 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GpnmbQ99P91 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GpnmbQ99P91 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GpnmbQ99P91 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GpnmbQ99P91 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
GpnmbQ99P91 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
GpnmbQ99P91 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
GpnmbQ99P91 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
GpnmbQ99P91 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
GpnmbQ99P91 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
GpnmbQ99P91 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GpnmbQ99P91 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GpnmbQ99P91 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GpnmbQ99P91 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GpnmbQ99P91 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GpnmbQ99P91 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
GpnmbQ99P91 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GpnmbQ99P91 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GpnmbQ99P91 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GpnmbQ99P91 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GpnmbQ99P91 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GpnmbQ99P91 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GpnmbQ99P91 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GpnmbQ99P91 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GpnmbQ99P91 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GpnmbQ99P91 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GpnmbQ99P91 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GpnmbQ99P91 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GpnmbQ99P91 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GpnmbQ99P91 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GpnmbQ99P91 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GpnmbQ99P91 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GpnmbQ99P91 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GpnmbQ99P91 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GpnmbQ99P91 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms