Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms