Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lims1Q99JW4 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13□□□□□ -0.33
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