Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Pacsin3Q99JB8 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
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