Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atl3Q91YH5 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Atl3Q91YH5 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Atl3Q91YH5 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atl3Q91YH5 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atl3Q91YH5 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atl3Q91YH5 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atl3Q91YH5 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atl3Q91YH5 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atl3Q91YH5 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atl3Q91YH5 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atl3Q91YH5 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atl3Q91YH5 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atl3Q91YH5 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Atl3Q91YH5 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Atl3Q91YH5 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atl3Q91YH5 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atl3Q91YH5 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atl3Q91YH5 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atl3Q91YH5 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atl3Q91YH5 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atl3Q91YH5 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atl3Q91YH5 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atl3Q91YH5 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atl3Q91YH5 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atl3Q91YH5 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atl3Q91YH5 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atl3Q91YH5 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atl3Q91YH5 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atl3Q91YH5 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atl3Q91YH5 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atl3Q91YH5 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atl3Q91YH5 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atl3Q91YH5 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atl3Q91YH5 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atl3Q91YH5 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atl3Q91YH5 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms