Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW3

Sh3bgrl3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl3Q91VW3 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sh3bgrl3Q91VW3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms