Protein–RNA interactions for Protein: Q91VH2

Snx9, Sorting nexin-9, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx9Q91VH2 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx9Q91VH2 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Snx9Q91VH2 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx9Q91VH2 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx9Q91VH2 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx9Q91VH2 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx9Q91VH2 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx9Q91VH2 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx9Q91VH2 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx9Q91VH2 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx9Q91VH2 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx9Q91VH2 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx9Q91VH2 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx9Q91VH2 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx9Q91VH2 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx9Q91VH2 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx9Q91VH2 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx9Q91VH2 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx9Q91VH2 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx9Q91VH2 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx9Q91VH2 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx9Q91VH2 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx9Q91VH2 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx9Q91VH2 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx9Q91VH2 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx9Q91VH2 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx9Q91VH2 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Snx9Q91VH2 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx9Q91VH2 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx9Q91VH2 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Snx9Q91VH2 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx9Q91VH2 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx9Q91VH2 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Snx9Q91VH2 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx9Q91VH2 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx9Q91VH2 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Snx9Q91VH2 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx9Q91VH2 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx9Q91VH2 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx9Q91VH2 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Snx9Q91VH2 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx9Q91VH2 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx9Q91VH2 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx9Q91VH2 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx9Q91VH2 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx9Q91VH2 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx9Q91VH2 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx9Q91VH2 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx9Q91VH2 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx9Q91VH2 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx9Q91VH2 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx9Q91VH2 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx9Q91VH2 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx9Q91VH2 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snx9Q91VH2 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx9Q91VH2 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx9Q91VH2 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snx9Q91VH2 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx9Q91VH2 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx9Q91VH2 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx9Q91VH2 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx9Q91VH2 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx9Q91VH2 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx9Q91VH2 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx9Q91VH2 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx9Q91VH2 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx9Q91VH2 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx9Q91VH2 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx9Q91VH2 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx9Q91VH2 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx9Q91VH2 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx9Q91VH2 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx9Q91VH2 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx9Q91VH2 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snx9Q91VH2 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx9Q91VH2 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms