Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDF2

Uhrf1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1Q8VDF2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms