Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nek9Q8K1R7 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nek9Q8K1R7 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nek9Q8K1R7 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Nek9Q8K1R7 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Nek9Q8K1R7 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek9Q8K1R7 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms