Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGV2

Tph2, Tryptophan 5-hydroxylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tph2Q8CGV2 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tph2Q8CGV2 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tph2Q8CGV2 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tph2Q8CGV2 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tph2Q8CGV2 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tph2Q8CGV2 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tph2Q8CGV2 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tph2Q8CGV2 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tph2Q8CGV2 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tph2Q8CGV2 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tph2Q8CGV2 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tph2Q8CGV2 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tph2Q8CGV2 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tph2Q8CGV2 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tph2Q8CGV2 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tph2Q8CGV2 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tph2Q8CGV2 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tph2Q8CGV2 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tph2Q8CGV2 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tph2Q8CGV2 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tph2Q8CGV2 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tph2Q8CGV2 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tph2Q8CGV2 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tph2Q8CGV2 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tph2Q8CGV2 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tph2Q8CGV2 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tph2Q8CGV2 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tph2Q8CGV2 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tph2Q8CGV2 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tph2Q8CGV2 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tph2Q8CGV2 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tph2Q8CGV2 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tph2Q8CGV2 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tph2Q8CGV2 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tph2Q8CGV2 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tph2Q8CGV2 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tph2Q8CGV2 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tph2Q8CGV2 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tph2Q8CGV2 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tph2Q8CGV2 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tph2Q8CGV2 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tph2Q8CGV2 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tph2Q8CGV2 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tph2Q8CGV2 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tph2Q8CGV2 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tph2Q8CGV2 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tph2Q8CGV2 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tph2Q8CGV2 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tph2Q8CGV2 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tph2Q8CGV2 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tph2Q8CGV2 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tph2Q8CGV2 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tph2Q8CGV2 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tph2Q8CGV2 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tph2Q8CGV2 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tph2Q8CGV2 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tph2Q8CGV2 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tph2Q8CGV2 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tph2Q8CGV2 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tph2Q8CGV2 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tph2Q8CGV2 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tph2Q8CGV2 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tph2Q8CGV2 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tph2Q8CGV2 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tph2Q8CGV2 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tph2Q8CGV2 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tph2Q8CGV2 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tph2Q8CGV2 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tph2Q8CGV2 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tph2Q8CGV2 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tph2Q8CGV2 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tph2Q8CGV2 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tph2Q8CGV2 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tph2Q8CGV2 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Tph2Q8CGV2 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tph2Q8CGV2 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tph2Q8CGV2 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tph2Q8CGV2 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tph2Q8CGV2 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tph2Q8CGV2 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tph2Q8CGV2 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tph2Q8CGV2 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tph2Q8CGV2 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tph2Q8CGV2 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tph2Q8CGV2 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tph2Q8CGV2 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tph2Q8CGV2 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tph2Q8CGV2 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tph2Q8CGV2 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tph2Q8CGV2 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tph2Q8CGV2 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Tph2Q8CGV2 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tph2Q8CGV2 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tph2Q8CGV2 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tph2Q8CGV2 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tph2Q8CGV2 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tph2Q8CGV2 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tph2Q8CGV2 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tph2Q8CGV2 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tph2Q8CGV2 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms