Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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