Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDW1

Fam228a, Protein FAM228A, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228aQ8CDW1 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam228aQ8CDW1 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam228aQ8CDW1 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam228aQ8CDW1 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Fam228aQ8CDW1 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam228aQ8CDW1 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam228aQ8CDW1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam228aQ8CDW1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam228aQ8CDW1 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam228aQ8CDW1 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Fam228aQ8CDW1 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam228aQ8CDW1 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam228aQ8CDW1 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam228aQ8CDW1 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam228aQ8CDW1 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fam228aQ8CDW1 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fam228aQ8CDW1 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam228aQ8CDW1 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam228aQ8CDW1 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam228aQ8CDW1 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam228aQ8CDW1 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fam228aQ8CDW1 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam228aQ8CDW1 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam228aQ8CDW1 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam228aQ8CDW1 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam228aQ8CDW1 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam228aQ8CDW1 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam228aQ8CDW1 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam228aQ8CDW1 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam228aQ8CDW1 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Fam228aQ8CDW1 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam228aQ8CDW1 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam228aQ8CDW1 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam228aQ8CDW1 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam228aQ8CDW1 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam228aQ8CDW1 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam228aQ8CDW1 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam228aQ8CDW1 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Fam228aQ8CDW1 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam228aQ8CDW1 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam228aQ8CDW1 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Fam228aQ8CDW1 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Fam228aQ8CDW1 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam228aQ8CDW1 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Fam228aQ8CDW1 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam228aQ8CDW1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Fam228aQ8CDW1 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam228aQ8CDW1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam228aQ8CDW1 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam228aQ8CDW1 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam228aQ8CDW1 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam228aQ8CDW1 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam228aQ8CDW1 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam228aQ8CDW1 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam228aQ8CDW1 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam228aQ8CDW1 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam228aQ8CDW1 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam228aQ8CDW1 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam228aQ8CDW1 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam228aQ8CDW1 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam228aQ8CDW1 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Fam228aQ8CDW1 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Fam228aQ8CDW1 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Fam228aQ8CDW1 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fam228aQ8CDW1 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fam228aQ8CDW1 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fam228aQ8CDW1 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Fam228aQ8CDW1 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Fam228aQ8CDW1 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Fam228aQ8CDW1 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Fam228aQ8CDW1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Fam228aQ8CDW1 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Fam228aQ8CDW1 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Fam228aQ8CDW1 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fam228aQ8CDW1 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Fam228aQ8CDW1 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fam228aQ8CDW1 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fam228aQ8CDW1 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fam228aQ8CDW1 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fam228aQ8CDW1 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fam228aQ8CDW1 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fam228aQ8CDW1 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fam228aQ8CDW1 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fam228aQ8CDW1 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fam228aQ8CDW1 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fam228aQ8CDW1 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fam228aQ8CDW1 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam228aQ8CDW1 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam228aQ8CDW1 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam228aQ8CDW1 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam228aQ8CDW1 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam228aQ8CDW1 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam228aQ8CDW1 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam228aQ8CDW1 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam228aQ8CDW1 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam228aQ8CDW1 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam228aQ8CDW1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam228aQ8CDW1 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam228aQ8CDW1 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam228aQ8CDW1 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms