Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc178Q8CDV0 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms