Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
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Pggt1bQ8BUY9 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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Pggt1bQ8BUY9 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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Pggt1bQ8BUY9 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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Pggt1bQ8BUY9 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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Pggt1bQ8BUY9 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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Pggt1bQ8BUY9 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms