Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMQ2

Gtf3c4, General transcription factor 3C polypeptide 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 817 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c4Q8BMQ2 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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