Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms