Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q6DFW0 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Q6DFW0 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q6DFW0 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q6DFW0 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Q6DFW0 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Q6DFW0 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Q6DFW0 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q6DFW0 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q6DFW0 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q6DFW0 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms