Protein–RNA interactions for Protein: Q61644

Pacsin1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin1Q61644 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacsin1Q61644 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms