Protein–RNA interactions for Protein: Q61003

Cd6, T-cell differentiation antigen CD6, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd6Q61003 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Cd6Q61003 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Cd6Q61003 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Cd6Q61003 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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