Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms