Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms