Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Nhlrc4Q3UP44 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nhlrc4Q3UP44 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nhlrc4Q3UP44 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nhlrc4Q3UP44 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nhlrc4Q3UP44 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nhlrc4Q3UP44 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nhlrc4Q3UP44 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nhlrc4Q3UP44 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nhlrc4Q3UP44 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nhlrc4Q3UP44 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nhlrc4Q3UP44 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nhlrc4Q3UP44 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nhlrc4Q3UP44 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc4Q3UP44 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc4Q3UP44 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc4Q3UP44 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc4Q3UP44 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc4Q3UP44 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc4Q3UP44 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc4Q3UP44 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc4Q3UP44 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc4Q3UP44 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc4Q3UP44 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc4Q3UP44 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc4Q3UP44 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc4Q3UP44 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc4Q3UP44 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc4Q3UP44 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc4Q3UP44 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc4Q3UP44 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc4Q3UP44 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc4Q3UP44 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc4Q3UP44 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc4Q3UP44 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc4Q3UP44 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc4Q3UP44 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc4Q3UP44 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc4Q3UP44 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc4Q3UP44 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc4Q3UP44 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc4Q3UP44 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc4Q3UP44 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlrc4Q3UP44 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlrc4Q3UP44 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlrc4Q3UP44 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlrc4Q3UP44 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlrc4Q3UP44 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlrc4Q3UP44 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlrc4Q3UP44 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlrc4Q3UP44 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlrc4Q3UP44 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlrc4Q3UP44 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlrc4Q3UP44 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlrc4Q3UP44 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlrc4Q3UP44 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlrc4Q3UP44 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlrc4Q3UP44 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlrc4Q3UP44 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlrc4Q3UP44 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlrc4Q3UP44 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlrc4Q3UP44 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlrc4Q3UP44 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlrc4Q3UP44 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlrc4Q3UP44 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlrc4Q3UP44 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlrc4Q3UP44 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlrc4Q3UP44 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlrc4Q3UP44 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nhlrc4Q3UP44 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nhlrc4Q3UP44 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nhlrc4Q3UP44 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nhlrc4Q3UP44 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nhlrc4Q3UP44 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nhlrc4Q3UP44 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nhlrc4Q3UP44 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nhlrc4Q3UP44 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nhlrc4Q3UP44 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nhlrc4Q3UP44 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nhlrc4Q3UP44 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nhlrc4Q3UP44 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nhlrc4Q3UP44 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nhlrc4Q3UP44 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nhlrc4Q3UP44 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nhlrc4Q3UP44 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nhlrc4Q3UP44 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nhlrc4Q3UP44 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nhlrc4Q3UP44 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nhlrc4Q3UP44 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nhlrc4Q3UP44 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nhlrc4Q3UP44 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nhlrc4Q3UP44 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nhlrc4Q3UP44 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nhlrc4Q3UP44 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nhlrc4Q3UP44 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nhlrc4Q3UP44 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nhlrc4Q3UP44 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nhlrc4Q3UP44 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nhlrc4Q3UP44 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nhlrc4Q3UP44 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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