Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Skap2Q3UND0 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms