Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnf180Q3U827 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnf180Q3U827 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnf180Q3U827 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnf180Q3U827 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnf180Q3U827 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnf180Q3U827 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnf180Q3U827 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnf180Q3U827 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnf180Q3U827 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnf180Q3U827 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnf180Q3U827 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf180Q3U827 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf180Q3U827 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf180Q3U827 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf180Q3U827 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf180Q3U827 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf180Q3U827 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf180Q3U827 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf180Q3U827 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf180Q3U827 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf180Q3U827 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf180Q3U827 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf180Q3U827 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf180Q3U827 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf180Q3U827 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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