Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem35bQ3U0Y2 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms