Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms