Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCH7

Cul4a, Cullin-4A, mousemouse

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4aQ3TCH7 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
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