Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam178bQ24JP3 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms