Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
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Spatc1Q148B6 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
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Spatc1Q148B6 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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Spatc1Q148B6 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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Spatc1Q148B6 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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Spatc1Q148B6 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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Spatc1Q148B6 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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Spatc1Q148B6 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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Spatc1Q148B6 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms