Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms