Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cnnm1Q0GA42 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms