Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms